آنالیز بیان افتراقی ژن‌ها در هسته سوپراپتیک شتر با استفاده از داده ای آر ان ای سک

Abstract

شترها به دلیل نقش چندمنظوره مانند شیر، تولید گوشت و پشم، حمل و نقل، مسابقه، گردشگری و کارهای کشاورزی نقش مهمی در زندگی انسان‌ها به ویژه در مناطق خشک دارند. علیرغم اهمیت عظیم اقتصادی، فرهنگی و بیولوژیکی آن، ژنوم شتر مورد مطالعه گسترده قرار نگرفته است. اندازه ژنوم شتر تقریباً 38/2 گیگاباز است که حاوی بیش از 20،000 ژن و 4،727،238 اس ان پی است. معماری ژنتیکی غیرمعمول شتر دلیل بقا و سازگاری آن با محیط سخت بیابان است. یکی از راه های دستیابی به این امر از طریق فعالیت هورمون وازوپرسین است که در قسمت خاصی از مغز به نام سیستم هیپوتالامو-نوروهیپوفیزال ساخته می¬شود، اما اثر خود را در کلیه برای تحریک حفظ آب اعمال می¬کند. مطالعات نشان داده که زیرساخت سیستم هیپوتالامو-نوروهیپوفیزال شتر براساس فصل تغییر می-کند و پیشنهاد شده¬است که در شرایط خشک تابستان سیستم هیپوتالامو-نوروهیپوفیزال در حالت فعال و آماده¬سازی برای احتمال محرومیت از آب است. در این تحقیق براساس توالی‌یابی ژنوم شتر تک‌کوهانه یک آنالیز RNAseq از سیستم هیپوتالامو-نروهیپوفیز در شرایط مختلف (زمستان نسبت به تابستان) انجام شد. نتایج نشان داد 4 رونوشت (از 51513 رونوشت) به¬طور قابل¬توجهی اختلاف معنی‌داری (05/0>FDR) در تغییرات بیان ژن داشتند به طوری¬که سه ژن بیان بالا و یک ژن بیان پائین داشتند.