CV


Hossein Naeemipour Younesi

Hossein Naeemipour Younesi

Assistant Professor

عضو هیئت علمی تمام وقت

Faculty: Agriculture

Department: Animal Sciences

Degree: Ph.D

Birth Year: 19730911

CV
Hossein Naeemipour Younesi

Assistant Professor Hossein Naeemipour Younesi

عضو هیئت علمی تمام وقت
Faculty: Agriculture - Department: Animal Sciences Degree: Ph.D | Birth Year: 19730911 |

First Semester of the Academic Year 2025–2026 (corresponding to 1404–1405 Hijri Shamsi)

My affiliation

Department of Animal Science, Faculty of Agriculture, Natural Resources and Environment, University of Birjand, Birjand, Iran

نمایش بیشتر

آنالیز بیان افتراقی ژن های غده هاردین مرغ در عفونت ویروسی بیماری نیوکاسل تحت استرس گرمایی با داده های Rna-seq

Authorsتیام رادین,حسین نعیمی پوریونسی,سید همایون فرهنگ فر
Conference Titleسومین همایش ملی پژوهش های نوین در علوم دامی با محوریت تنش های محیطی
Holding Date of Conference2023-02-15
Event Placeبیرجند
Page number0-0
PresentationPOSTER
Conference LevelInternal Conferences

Abstract

مقدمه: در پشت هر چشم مرغ یک بافت لنفاوی منحصر به فرد به نام غده هاردرین وجود دارد که تجزیه و تحلیل توالی RNA RNA-seq)) برای آن جدید است. این سلولها وابسته هم به تیموس و هم بورس فابرسیوس وابسته است. ویروس بیماری نیوکاسل، معیشت مرغداران روستایی که زیرساخت­ها و خدمات محدودی برای واکسیناسیون و جلوگیری از شیوع ویروس دارند را تهدید می­کند. هدف از این مطالعه، آنالیز بیان افتراقی ژن­ها در غده هاردرین مرغ تحت عفونت با نیوکاسل در طیور لگهورن تحت استرس حرارتی بود. مواد و روش ها: در این تحقیق به منظور آنالیز بیان افتراقی ژن­ها در غده هاردرین مرغ تحت تنش گرمایی 6 ساعت پس از بیماری نیوکاسل در طیور لگهورن، از داده های مربوط به یک مطالعه RNA-seq با شماره دسترسی GSE118010 از سایت NCBI استفاده گردید. کیفیت و پیرایش خوانش­ها، نقشه یابی خوانش­ها روی ژنوم مرجع و خلاصه­سازی خوانش­های توالی خام روی این داده­ها صورت گرفته بود و به صورت ماتریس خوانش­های نقشه­یابی سطح ژن در سایت NCBI بارگذاری شده بودند. آنالیز داده­ها با یک برنامه تحت وب یکپارچه (iDEP) انجام شد. نتایج و بحث: اختلاف مشخصی بین دو گروه بدون چالش و چالش با ویروس نیوکاسل دیده شد که در امتداد اولین مولفه اصلی 79 درصد واریانس را توضیح داد. با بسته نرم افزاری DEseq2 و در گروه ازمایشی بدون چالش نسبت به گروه ازمایشی چالش با ویروس نیوکاسل در شرایط تنش گرمایی 1260 ژن بیان بالا و 432 ژن با بیان پائین و با آستانه میزان کشف اشتباه (FDR<0.01) و تغییر بیش از دو برابر شناسایی شدند. نتیجه گیری کلی: این مطالعه بینش جدیدی در مورد پاسخ رونویسی بافت غده هادرین مرغ در عفونت ویروسی بیماری نیوکاسل تحت استرس گرمایی با داده­های RNA-Seq ارائه نموده است.

Paper URL