تحلیل ترانسکریپتومی اثر بربرین بر کبد چرب غیر الکلی

Abstract

کبد چرب غیرالکلی (NAFLD) یکی از اختلالات شایع متابولیک است که با تجمع لیپید و اختلال در هموستاز انرژی همراه بوده و نقش ترکیبات گیاهی در بهبود آن مورد توجه قرار گرفته است. بربرین به‌عنوان یک متابولیت طبیعی با اثرات ضدالتهابی و تنظیم‌کنندۀ متابولیسم، عملکرد بالقوه‌ای در اصلاح اختلالات ناشی از NAFLD دارد، اما مکانیسم‌های مولکولی آن به‌طور کامل روشن نیست. در این پژوهش، با هدف شناسایی مکانیسم‌های مولکولی اثر محافظتی بربرین از داده‌های RNA-Seq با شماره دسترسی GSE252928 که در پایگاهNCBI موجود است با استفاده از نرم‌افزار iDEP آنالیز شدند. در چهار گروه شامل A (مبتلا)، AB (درمان‌شده با بربرین)، NC (کنترل نرمال) و NCB (کنترل نرمال+ بربرین)، تفاوت‌های بیان ژنی بررسی شد. از برترین ژن‌ها 1۰00 ژن (براساس توزیع واریانس همه ژن‌ها) در یک خوشه‌بندیk -Means به 6 خوشه تقسیم‌شدند. در آنالیز بیان افتراقی ژن‌ها، از میان 17824 ژن که از فیلتر عبور کردند، 98 ژن بیان بالا و 88 ژن بیان پایین داشتند. تحلیل غنی‌سازی KEGG نشان داد مسیرهای زیستی اسکلت سلولی در سلول‌های عضلانی، مسیر سیگنال‌دهیcAMP، تعامل لیگاند-گیرنده عصبی، پروتئین‌های موتوری، تقویت بلندمدت و سیناپس دوپامینرژیک به‌طور معناداری غنی‌سازی شده‌اند. به طور کلی، این یافته‌ها حاکی از آن است که بربرین با تنظیم تعادل متابولیک، کاهش التهاب و بهبود عملکرد سلولی، می‌تواند در مدیریت کبد چرب غیرالکلی مؤثر باشد.