تحلیل ترانسکریپتومی اثر محافظتی بربرین بر سمیت روده‌ای ناشی از شیمی‌درمانی با نرم افزار تحت وب iDEP

Abstract

بربرین (BBR) یک آلکالوئید ایزوکوینولین است که در درمان موکوزیت روده‌ای مورد استفاده قرار گرفته است. با این حال، اثر بربرین بر موکوزیت ناشی از شیمی‌درمانی در بیماران مبتلا به سرطان تا حد زیادی ناشناخته باقی مانده است. فلورواوراسیل (5-Fu) به عنوان یکی از داروهای شیمی‌درمانی برجسته در درمان سرطان کولورکتال (CRC) شناخته می‌شود، اما اغلب با بروز سمیت‌های گوارشی، به‌ویژه اسهال، همراه است. بربرین با تعدیل میکروبیوتای روده، آسیب مخاطی ناشی از5-Fu را در مدل‌های حیوانی بهبود می‌بخشد با این حال، مکانیسم مولکولی دقیق اثر محافظتی بربرین بر مخاط روده همچنان ناشناخته باقی مانده و تأثیر آن بر کارایی ضدتوموری5-Fu نیازمند بررسی بیشتر است. در این مطالعه برای بررسی مکانیسم مولکولی دقیق اثر محافظتی بربرین بر مخاط روده در موش‌های تحت درمان با 5-Fu با یا بدون تجویز بربرین با استفاده از داده‌های RNA-seq که با شماره دسترسیGSE215201 در سایت NCBI موجود است ارزیابی شد. نتایج نشان داد که مسیرهای زیستی ترشح پانکراس، هضم و جذب پروتئین، متابولیسم اسید آراشیدونیک، متابولیسم اسید لینولئیک، متابولیسم رتینول، تنظیم مدیاتورهای التهابی کانال‌هایTRP، مسیر سیگنالینگIL-17، برهم‌کنش سایتوکاین و گیرنده، مسیر سیگنالینگ کموکاین و فاگوزوم تحت تأثیر بربرین به طور معنی‌داری غنی شده‌اند. تحلیل جامع ترانسکریپتومی نشان داد که بربرین با تعدیل بیان ژنی مرتبط با مسیرهای مهم زیستی مانند ترشح پانکراس، هضم و جذب پروتئین، متابولیسم اسیدهای چرب و تنظیم پاسخ‌های التهابی، نقش مؤثری در کاهش سمیت روده‌ای ناشی از شیمی‌درمانی دارد. در مجموع، یافته‌های این مطالعه بیانگر اثر حفاظتی بربرین بر فرآیندهای ترمیمی و ایمنی روده در شرایط تنش دارویی است.