آنالیز بیان ژن در اندومتریوم گاوهای بارور و کم‌بارور

چکیده مقاله

به منظور مشخص شدن دلایل عدم موفقیت در تولیدمثل، آنالیز بیان ژن در اندومتریوم گاوهای بارور و کم‌بارور و برای تشخیص تفاوت‌ها در الگوهای بیان ژن در اندومتریوم گاوهای بارور و گاوهای کم‌بارور، نمونه‌های بیوپسی اندومتریوم 6 رأس گاو بارور و 5 راس گاو کم‌بارور در روز هفتم چرخه فحلی جمع آوری گردید. برای بررسی تفاوت بیان ژن‌ها از بسته نرم¬افزاری limma استفاده شد و براساس آستانه میزان کشف اشتباه (FDR 0.1) و تغییرات مساوی یا بیش از دو برابر و با مقایسه تفاوت بیان ژن¬ها در گروه گاوهای بارور در مقابل گاوهای کم بارور تعداد ژن‌های با بیان بالا و پائین به¬ترتیب 435 و 1509 ژن بود. براساس روش خوشه‌بندیK-means ، 1000 ژن که بیشترین تغییرات را داشتند به پنج خوشه تقسیم شدند. درون شناختی ژن براساس دیدگاه فرایند زیستی نشان داد، مسیر زیستی تنظیم کیفیت بیولوژیکی (80 ژن) در خوشه A از جمله مسیرهای غنی شده با بالاترین معنی¬داری بود. نتایج نشان داد بیان ژن ژن‌های رمزنویسی شده DNA میتوکندریایی در گاوهای کم‌بارور از گاوهای بارور بالاتر بود و نرم‌افزار تحت وب iDEP می‌تواند به شناسایی مسیرهای زیستی درگیر و همچنین ژن‌های کاندید برای گاوهای بارور و کم بارور کمک کند.