کارایی نشانگرهای مولکولی RAPD و SCOT در تمایز جمعیتهای خارشتر (Alhagi maurorum)

نویسندگانمحمد ضابط,سمانه پیش قدم نیل آباد,زهره علیزاده
نشریهتحقیقات ژنتیک و اصلاح گیاهان مرتعی و جنگلی ایران
شماره صفحات۱۶-۳۸
شماره سریال۳۰
شماره مجلد۱
نوع مقالهFull Paper
تاریخ انتشار۲۰۲۲
رتبه نشریهISI
نوع نشریهچاپی
کشور محل چاپایران
نمایه نشریهisc

چکیده مقاله

بررسی تنوع ژنتیکی اهمیت ویژهای در درک چگونگی ایجاد جمعیتها در طول زمان و مکانهای جغرافیایی دارند. در این تحقیق تنوع ژنتیکی 22 جمعیت خارشتر ) Alhagi maurorum ( با استفاده از 22 آغازگر RAPD و 20 آغازگر SCOT طی سالهای 1082-83 مورد مطالعه قرار گرفت. از 22 آغازگر RAPD 18 و از 20 آغازگر ، SCOT 13 آغازگر چندشکلی بالایی نشان دادند. ، در مجموع آغازگرهای RAPD 133 درصد چندشکلی و آغازگرهای ، SCOT 89/02 درصد چندشکلی نشان دادند. بالاترین شاخص ، محتوای اطلاعات چندشکلی را آغازگرهای R3 و R11 3/02 ( و ( S12 3/00 (، بالاترین شاخص نسبت چندشکلی ) ( EMR ( را آغازگرهای R10 12 ( و ( S2 ، S4 ، S6 ، S7 و S10 10 (، بالاترین شاخص نشانگری ) ( MI ( را آغازگرهای R13 9/82 ( و ( S7 )9/01( و بالاترین شاخص قدرت تفکیک ) RP ( را آغازگرهای R4 8/90 ( و ( S14 11/2 ( به خود اختصاص دادند. نتایج تجزیه واریانس ( مولکولی نشان داد که در هر دو نشانگر 10 درصد از تغییرات مربوط به بین گروهها و 31 درصد مربوطه به درون گروهها بود. تجزیه خوشه ای بر اساس دادههای نشانگر RAPD ، جمعیتها را در سه و بر اساس نشانگر SCOT ، جمعیتها را در شش خوشه گروهبندی نمود. بررسی خوشه ها نشان داد که تنوع ژنتیکی از تنوع جغرافیایی تبعیت نمی کند و پیشنهاد می شود که در مطالعات آتی از تلاقی بین جمعیت تهران با جمعیتهای گناباد، طبس، بشرویه، سربیشه و نیلشهر که فاصله ژنتیکی بیشتری دارند، جهت ایجاد دورگهای برتر استفاده شود. کلیه پارامترهای ژنتیکی در هر دو نشانگر تقریبا برابر و بر این اساس کارایی هر دو نشانگر در مطالعه کنونی تقریباً یکسان بود.

لینک ثابت مقاله

tags: تجزیه خوشه ای، جریان ژنی، چندشکلی، شاخص شانون، هتروزیگوسی