بررسی متاژنومیکس ویروس های آلوده کننده گیاه زعفران

Abstract

مطالعه ژنومیکس ویروس های گیاه زعفران طی سال های 1401 ال 1403 در 208 نمونه جمع آوری شده از مزارع زعفران استان های خراسان رضوی، خراسان جنوبی و شمالی به منظور شناسایی بیماری های ویروسی جدید انجام شد. آزمون VANA برای شناسایی و بررسی مولکولی این ویروس ها مورد استفاده قرار گرفت. نتایج حاصل از روش وانا ابتدا تعیین کیفیت گردید و تعداد 5042 خوانش حذف گردید. در ده نمونه خوانش ها انجام نشد که از مطالعه حذف گردید. در 106 نمونه از کل نمونه ها توالی های ویروس های گیاهی یافت شد که این توالی ها با استفاده از Blast n و blast X بررسی و با داده های موجود در بانک ژن مقایسه گردید. عمده جنس های ویروسی تعیین توالی شده در این تحقیق مربوط به Mastervirus, Potyvirus, Tobamovirus, Crinivirus, Caulimovirus, Victovirus , partitivirus. بودند.