| 1 | Innovative Approaches for Removing Reactive Yellow 145 Dye Pollutants from Water Sources | _ | Environmental Resources Research | 0 |
| 2 | Investigating the Extraction of Lead and Zinc from the Zinc Processing Residue Using the Enhanced Electrokinetic Process | _ | RSC Advances | 0 |
| 3 | کاربرد شبکه عصبی GMDH و الگوریتم ژنتیک در مدل سازی درصد متان موجود در گاز مراکز دفن زباله | محمد جواد ذوقی,غمگسار محمد,گنجی مسلم,فلاحی سعید | علوم و تکنولوژی محیط زیست | 2016 |
| 4 | رویکردی در طراحی محل دفن بهداشتی جهت تصفیه و استفاده از گازهای ناشی از تجزیه در شبکه گاز شهری | محمد جواد ذوقی,محمدرضا دوستی | علوم و تکنولوژی محیط زیست | 2019 |
| 5 | بررسی کارایی تالاب مصنوعی زیرسطحی افقی متعارف و بافل دار در حذف رنگ راکتیو قرمز 198 | محمد جواد ذوقی,هادی انتظاری زارچ,محمدرضا دوستی,سمیه رحمانی | سلامت و محیط زیست | 2020 |
| 6 | بررسی تجمع فلزات سنگین در گیاهان آبیاری شده با آب چاه و فاضلاب تصفیه شده‌ی شهر بیرجند | محمد جواد ذوقی,محمدرضا دوستی | مهندسی بهداشت محیط | 2020 |
| 7 | راندمان حذف آنتی بیوتیک پنی سیلین جی در تالاب مصنوعی با جریان افقی زیرسطحی | محمد جواد ذوقی,محمدرضا دوستی,وحید گل کاری | نشریه مهندسی عمران امیر کبیر | 2021 |
| 8 | مقایسه راکتورهای UASB معمول و اصلاح شده در تصفیه پساب صنایع لبنی | محمد جواد ذوقی,مرتضی یگانه میرزاعلیلو,محمدرضا دوستی,سمیه رحمانی | نشریه مهندسی عمران امیر کبیر | 2021 |
| 9 | تثبیت و جامدسازی خاک آلوده به سرب با سیمان منیزیم فسفات و سیمان پرتلند | محمد جواد ذوقی,محمدرضا دوستی | مهندسی بهداشت محیط | 2021 |
| 10 | کاربرد روش سطح پاسخ در بهینه سازی فرایند ماورا بنفش/ پراکسید هیدروژن در حذف رنگزای واکنشی قرمز 195 از محلول آبی | محمد جواد ذوقی | سلامت و محیط زیست | 2021 |
| 11 | بررسی کارایی فرآیند لجن فعال با هوادهی گسترده و برگشت لجن در کاهش COD پساب صنایع نوشابه‌سازی | محمد جواد ذوقی,محمدرضا دوستی,محمد حسین ربیعی گسک,مهدی ایوبی | نشریه مهندسی عمران امیر کبیر | 2022 |
| 12 | کارایی همبندکننده‌های مختلف در تثبیت و جامدسازی فلزات سنگین و مقاومت فشاری لجن کارخانه کاشی و سرامیک نیلوفر بیرجند | محمد جواد ذوقی,مهدی ایوبی,بهنوش خطائی | نشریه مهندسی عمران امیر کبیر | 2023 |
| 13 | Robust deep learning method for fruit decay detection and plant identification: enhancing food security and quality control | Pariya Afsharpour,Toktam Zoughi,Mahmood Deypir | Frontiers in Plant Science | 2024 |