گزارش مولکولی از وقوع ویروس پنهان زعفران روی بخش های مختلف گیاه زعفران

چکیده مقاله

ویروس پنهان زعفران (Saffron Latent Virus, SaLV)، یک گونه جدید از جنس Potyvirus است که به تازگی در ایران شناسایی شده است. علی‌رغم اینکه بسیاری از علایم این ویروس مخفی می‌باشد، اما خسارت آن در مزارع زعفران قابل ملاحظه است. برای بررسی این ویروس تعداد 152 نمونه از برگ، گل و بنه زعفران‌های بدون علایم و دارای علایم کوتولگی، زردی و پیچیدگی از مزارع استان‌های خراسان جنوبی و رضوی،جمع‌آوری گردید. پس از استخراج RNA ، با استفاده از واکنش زنجیره‌ای پلیمراز معکوس (RT-PCR) و آغازگرهای اختصاصی مربوط به پروتئین پوششی، حضور SaLV مورد بررسی قرار گرفت. نتایج نشان داد تعداد 92 نمونه از 152 نمونه (معادل 60%) آلوده به ویروس بودند. در نهایت 7 نمونه به عنوان نمونه هایی که برمبنای شهرستان محل نمونه برداری از 92 نمونه تکثیر شده در آزمون زنجیره ای پلیمراز، انتخاب شده بودند مورد توالی¬یابی قرار گرفتند. از آنجائیکه جدایه‌های مربوط به یک منطقه و یک محصول در گروه های مختلف پخش شده، بنابراین منطقه جغرافیایی جداسازی و نوع میزبان در تبارزایی ویروس تاثیر گذار نمی باشد. تحقیق حاضر برای اولین بار به ردیابی ویروس از روی گل و بنه زعفران و نیز بررسی تبارزایی جدایه های این ویروس جدید بر مبنای پروتئین پوششی در ایران می پردازد.