ردیابی و بررسی جایگاه تبارزایی ویروس پنهان زعفران virus latent Saffron در مزارع زعفران استانهای خراسان جنوبی و رضوی

چکیده مقاله

ویروس پنهان زعفران )SaLV ,Virus Latent Saffron)، یک گونه جدید از جنس Potyvirus است که به تازگی در ایران شناسایی شده است. علیرغم اینکه بسیاری از عالیم این ویروس مخفی میباشد، اما خسارت آن در مزارع زعفران قابل مالحظه است. علیرغم شناسایی این ویروس، تاکنون بررسی تبارزایی جدایههای آن بر مبنای پروتئین پوششی صورت نگرفته است. برای بررسی این ویروس تعداد 152 نمونه از برگ، گل و بنه زعفرانهای بدون عالیم و دارای عالیم کوتولگی، زردی و پیچیدگی از مزارع استانهای خراسان جنوبی و رضوی، جمعآوری گردید. پس از استخراج RNA، با استفاده از واکنش زنجیرهای پلیمراز معکوس )PCR-RT )و آغازگرهای اختصاصی مربوط به پروتئین پوششی، حضور SaLV مورد بررسی قرار گرفت. نتایج نشان داد تعداد 92 نمونه از 152 نمونه )معادل %60( آلوده به ویروس بودند. در نهایت هفت نمونه به عنوان نمونههایی که برمبنای شهرستان محل نمونهبرداری از 92 نمونه تکثیر شده در آزمون زنجیرهای پلیمراز، انتخاب شده بودند مورد توالییابی قرار گرفتند. بررسیهای تبارزایی، بر پایه پروتئین پوششی و با نرم افزار MEGAX، نشان داد که جدایههای این ویروس دو گروه مجزا تشکیل دادند، که جدایههای مورد مطالعه در این تحقیق در گروه دوم قرار گرفتند. از آنجائیکه جدایههای مربوط به یک منطقه و یک محصول در گروه های مختلف پخش شده، بنابراین منطقه جغرافیایی جداسازی و نوع میزبان در تبارزایی ویروس تاثیر گذار نمیباشد. تحقیق حاضر برای اولین بار به ردیابی ویروس از روی گل و بنه زعفران و نیز بررسی تبارزایی جدایههای این ویروس جدید بر مبنای پروتئین پوششی در ایران میپردازد.