| 1 | ارزیابی و پهنه بندی آلودگی هوای کلانشهر تبریز | مرتضی اسمعیل نژاد,محمد اسکندری ثانی,بارزمان سپیده | برنامه ریزی منطقه‌ای | 2015 |
| 2 | تحلیلی بر فرهنگ و رفتارهای زیست‌محیطی مسئولانه شهروندان بیرجندی | مرتضی اسمعیل نژاد,محمد اسکندری ثانی | انسان و محیط زیست | 2021 |
| 3 | بحران آب و ضرورت تغییر الگوی کشت در مناطق خشک | مرتضی اسمعیل نژاد,طاوسی تقی,محمد اسکندری ثانی | کاوش های جغرافیایی مناطق بیابانی | 2014 |
| 4 | نقش بافت تاریخی در ارتقا مولفههای رقابتپذیری شهری مورد مطالعه شهر بیرجند | محمد اسکندری ثانی,یغفوری حسین,اکبری فاطمه | برنامه ریزی فضایی | 2017 |
| 5 | تحلیل جایگاه حکمروایی شایست شهری و برنامه ریزی راهبردی آن )مطالع موردی شهر بیرجند( | محمد اسکندری ثانی,یغفوری حسین,ارشد حامد | پژوهش‌های جغرافیایی برنامه ریزی شهری | 2016 |
| 6 | ارزیابی میزان مشارکت شهروندان در مدیریت شهری بر اساس الگوی حکمروایی شایسته شهری، مورد شناسی منطقه آزاد ارس (شهر جلفا) | محمد اسکندری ثانی,ملا زاده مهدی,پورداداش امیر | برنامه ریزی منطقه‌ای | 2017 |
| 7 | تحلیل معیارهای تأثیرگذار بر توسعه گردشگری شهری پایدار(مطالعه موردی، شهر شاهرود) | محمد اسکندری ثانی,مصطفی الطافی,صدرالدین متولی,غلامرضا جانباز قبادی | جغرافیا و پایداری محیط | 2022 |
| 8 | ارزیابی نقش نهادگرایی در روند توسعه پایدار مناطق مرزی(موردمطالعه استان خراسان جنوبی) | محمد اسکندری ثانی,مرتضی اسمعیل نژاد,خلیل خزا ئی | پژوهشنامه جغرافیای انتظامی | 2018 |
| 9 | مکانی ابی ت سیسات و تجهیزات شهری د ر راستای بهر هوری از زمان طلایی م دیریت بحران | محمد اسکندری ثانی,مرتضی اسمعیل نژاد | دانش پیشگیری و مدیریت بحران | 2016 |
| 10 | بررسی عوامل مؤثر بر حمل و نقل پایدار شهری بر پایه نظریه اقتصاد سبز مورد مطالعه: شهر بیرجند | محمد اسکندری ثانی,محمود مردای,افسانه ابراهیمی | پژوهش و برنامه‌ریزی شهری | 2019 |
| 11 | ارزیابی پتانسیل‌های پیاده‌سازی شهر هوشمند با تأکید بر حمل‌ونقل، موردمطالعه: شهر بیرجند | محمد اسکندری ثانی,محمود مرادی,پروین قادری مقدم | کاوش های جغرافیایی مناطق بیابانی | 2018 |
| 12 | بررسی راهکارهای توسعه منطقه ای استان خراسان رضوی با رویکرد رقابت-پذیری منطقه ای | محمد اسکندری ثانی,کرامت الله زیاری,فاطمه کهکی,سیروس رامش | جغرافیا (برنامه‌ریزی منطقه‌ای) | 2020 |
| 13 | تبیین ضرورت تاب آوری پویا در طرح های آمایش سرزمینی رهیافتی در جهت انعطاف پذیری اقتصاد منطقه ای (نمونه مورد مطالعه: استان خراسان جنوبی) | محمد اسکندری ثانی,فلاح محبوبه | نگرش های نو در جغرافیای انسانی | 2019 |
| 14 | امکان سنجی ایجاد منطقه ویژه اقتصادی کاشمر راهکاری برای توسعه خوشه های صنعتی و کسب و کار در راستای توسعه پایدار ناحیه ترشیز | محمد اسکندری ثانی,فاطمه السادات کهکی | نگرشهای نو در جغرافیای انسانی | 2019 |
| 15 | شبیه‌سازی و پیش‌بینی الگوی رشد شهری تا سال 1430 با استفاده از مدل SLEUTH-3R (مطالعه موردی: شهر زاهدان) | محمد اسکندری ثانی,عطالله اکبری,مرتضی اسمعیل نژاد | جغرافیا و توسعه ناحیه ای | 2023 |
| 16 | ارزیابی شاخص‌های موثر بر تحقق الگوی کاربری زمین و گسترش آتی محدوده‌های شهری در طرح‌های توسعه (نمونه موردی طرح جامع شهر زاهدان) | محمد اسکندری ثانی,عطاالله اکبری,مرتضی اسمعیل نژاد | تحقیقات جغرافیایی | 2022 |
| 17 | شناسایی مؤلفه‌های کالبدی مؤثر در بهبود احساس امنیت شهروندان در فضاهای شهری (نمونه موردی: خیابان معلم و پاسداران شهر بیرجند) | محمد اسکندری ثانی,سحر سفالگر | فرهنگ خراسان | 2022 |
| 18 | ارزیابی بسترهای فناوری بلاک چین در راستای توسعه گردشگری پایدار در ایران | محمد اسکندری ثانی,سحر سفالگر | چشم انداز شهرهای آینده | 2023 |
| 19 | تحلیلی انتقادی بر سیاست شهری آب از منظر ظرفیت نهادی (مورد شناسی: شهر بیرجند) | محمد اسکندری ثانی,رضایی ابراهیم,ابراهیم زاده عیسی | جغرافیا و آمایش شهری - منطقه‌ای | 2019 |
| 20 | آینده پژوهی مدیریت شهری زمینه ساز تحقق رقابت پذیری در عرصهءگردشگری (نمونهءموردی: شهر زاهدان) | محمد اسکندری ثانی,رضایی ابراهیم | جغرافیای اجتماعی شهری | 2019 |